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Quantifying Possible Routes for SpnF-Catalyzed Formal Diels-Alder Cycloaddition

Medvedev, Michael G ; Zeifman, Alexey A ; Novikov, Fedor N ; Bushmarinov, Ivan S ; Stroganov, Oleg V ; Titov, Ilya Yu ; Chilov, Ghermes G ; Svitanko, Igor V

Journal of the American Chemical Society, 22 March 2017, Vol.139(11), pp.3942-3945 [Rivista Peer Reviewed]

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2,3-Dihydroxy-quinoxaline induces ATPase activity of Herpes Simplex Virus thymidine kinase

Zeifman, Alexey A ; Novikov, Fedor N ; Stroylov, Victor S ; Stroganov, Oleg V ; Chilov, Ghermes G ; Skoblov, Alexander Y ; Miroshnikov, Anatoly I ; Skoblov, Yuri S

FEBS Letters, 31 January 2014, Vol.588(3), pp.509-511 [Rivista Peer Reviewed]

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An explicit account of solvation is essential for modeling SuzukiMiyaura coupling in protic solvents

Zeifman, Alexey A. ; Novikov, Fedor N. ; Stroylov, Victor S. ; Stroganov, Oleg V. ; Svitanko, Igor V. ; Chilov, Ghermes G.

Dalton Transactions, Dalton Transactions, 2015, Vol.44(40), pp.17795-17799 [Rivista Peer Reviewed]

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TSAR, a new graph–theoretical approach to computational modeling of protein side‐chain flexibility: Modeling of ionization properties of proteins

Stroganov, Oleg V. ; Novikov, Fedor N. ; Zeifman, Alexey A. ; Stroylov, Viktor S. ; Chilov, Ghermes G.

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, September 2011, Vol.79(9), pp.2693-2710 [Rivista Peer Reviewed]

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Hit clustering can improve virtual fragment screening: CDK2 and PARP1 case studies

Zeifman, Alexey ; Stroylov, Victor ; Novikov, Fedor ; Stroganov, Oleg ; Zakharenko, Alexandra ; Khodyreva, Svetlana ; Lavrik, Olga ; Chilov, Ghermes

Journal of Molecular Modeling, 2012, Vol.18(6), pp.2553-2566 [Rivista Peer Reviewed]

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CSAR scoring challenge reveals the need for new concepts in estimating protein-ligand binding affinity

Novikov, Fedor N ; Zeifman, Alexey A ; Stroganov, Oleg V ; Stroylov, Viktor S ; Kulkov, Val ; Chilov, Ghermes G

Journal of chemical information and modeling, 26 September 2011, Vol.51(9), pp.2090-6 [Rivista Peer Reviewed]

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Lead Finder docking and virtual screening evaluation with Astex and DUD test sets

Novikov, Fedor N ; Stroylov, Viktor S ; Zeifman, Alexey A ; Stroganov, Oleg V ; Kulkov, Val ; Chilov, Ghermes G

Journal of computer-aided molecular design, June 2012, Vol.26(6), pp.725-35 [Rivista Peer Reviewed]

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The first synthesis and molecular docking studies of diastereomerically pure substituted 4-amino-7-hydroxyheptanoic acids

Sukhorukov, Alexey Yu ; Andryushkevich, Svetlana O ; Chilov, Ghermes G ; Zeifman, Alexey A ; Svitanko, Igor V ; Ioffe, Sema L

Mendeleev Communications, 2011, Vol.21(4), pp.183-185 [Rivista Peer Reviewed]

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Modeling of the Diels–Alder reaction enantioselectivity by quantum mechanics and molecular mechanics

Zeifman, Alexey A ; Stroylov, Viktor S ; Titov, Ilya Yu ; Novikov, Fedor N ; Stroganov, Oleg V ; Svitanko, Igor V ; Chilov, Ghermes G

Mendeleev Communications, July 2015, Vol.25(4), pp.269-270 [Rivista Peer Reviewed]

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Alchemical FEP Calculations of Ligand Conformer Focusing in Explicit Solvent

Zeifman, Alexey A ; Stroylov, Victor V ; Novikov, Fedor N ; Stroganov, Oleg V ; Kulkov, Val ; Chilov, Ghermes G

Journal of chemical theory and computation, 12 February 2013, Vol.9(2), pp.1093-102 [Rivista Peer Reviewed]

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